潔凈空調技術在世界上已經歷了半個多世紀的發展，隨著科技與經濟的發展，其應用范圍愈加廣泛，而且技術要求也更為復雜。目前它的代表性應用主要是在微電子工業、醫療衛生及食品工業等。
1．微電子工業
微電子工業是當前對潔凈室要求最高的行業。大規模和超大規模集成電路（LSI、ULSI）以及液晶顯示器（LCD）的生產與發展，對潔凈度的要求越來越高。集成電路制造工藝中，集成度越大，則圖形尺寸（以線寬為代表）越細，從而對潔凈室控制粒徑的尺寸也越小，且允許顆粒物濃度也越低。此外，如現代工業中的液晶、光纖等的生產，同樣均有很高的潔凈度要求。
2．醫藥工業
（1）藥品生產
制藥廠的生產環境對藥品的生產質量、人體健康有重大關系。我國《藥品生產管理規范》（即GMP）早已在全國范圍內實施，對生產環境提出了相應于工藝過程不同的潔凈度級別要求。對于原料藥制備、粉劑、針劑、片劑、大輸液的生產、灌裝等工藝，均已制定了潔凈區和控制區的潔凈標準。作為生物潔凈室，在對生物粒子（細菌數）有明確的限制條件之外，還限定空氣中塵埃粒子的含量。
（2）醫院
白血病的治療室、燒傷病房、急性傳染病的預防、外科手術室，也必須根據具體條件采用潔凈技術，以防止空氣中細菌感染，對治療起到環境的保障作用。
（3）醫學科學實驗
對于實驗動物的飼養、遺傳工程等醫學科學實驗過程，亦需配備潔凈環境，才能取得有效的成果。為此，以潔凈技術為重要手段的生物安全技術也得到迅速的發展。
3．食品工業
食品的無菌包裝（如軟包裝鮮果汁、牛乳等），在保持食品色、香、味、營養等方面大大優于用高溫殺菌的罐裝食品。所謂無菌包裝，就是在潔凈環境中完成包裝工藝。我國已開始在某些食品行業內引入并推進《危害性臨界控制點》（HACCP）的法規制定，其內容也與生產過程中潔凈控制有關。
4．其它
其他如宇航工業、精密機械工業、儀器儀表工業、精細化學工業及日用化工等行業，均廣泛地應用了潔凈技術。
